Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vwa5b2Q3UR50 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms