Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam83fQ3UKU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms