Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6cQ3UHC0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms