Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH99

Shisa6, Protein shisa-6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa6Q3UH99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa6Q3UH99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa6Q3UH99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms