Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms