Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms