Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud5Q3U2S4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud5Q3U2S4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms