Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem35bQ3U0Y2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms