Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms