Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc4Q3TR08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc4Q3TR08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms