Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ctdnep1Q3TP92 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdnep1Q3TP92 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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