Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms