Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms