Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms