Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stt3bQ3TDQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms