Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms