Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptcd3Q14C51 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms