Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rpusd3Q14AI6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms