Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms