Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2bQ0KL01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms