Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms