Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms