Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms