Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ebf1Q07802 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms