Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah1bQ06985 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms