Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r236Q05A06 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms