Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx2Q04744 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Emx2Q04744 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms