Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnb1Q03717 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms