Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddr1Q03146 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms