Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr1fQ02284 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms