Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnb1Q02248 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms