Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms