Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2bQ01097 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms