Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde4dQ01063 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde4dQ01063 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde4dQ01063 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde4dQ01063 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde4dQ01063 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms