Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms