Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms