Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms