Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brca2P97929 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms