Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms