Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms