Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LystP97412 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LystP97412 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LystP97412 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LystP97412 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms