Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhodP97348 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhodP97348 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms