Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms