Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct5P80316 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms