Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp4P70343 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp4P70343 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms