Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tbx6P70327 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms