Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc9P70170 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc9P70170 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms