Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f4P62515 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f4P62515 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms