Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm6P62313 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms