Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga11P61622 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms